CICC微生物菌种鉴定评价技术服务始于上世纪90年代，2003年取得“国家工商总局经营许可”，2012年取得ISO 9001质量管理体系认证，2016年取得ISO 17025检测实验室能力认可，2018年取得CMA检验检测机构资质认定，出具的检测报告获得国际互认。CICC提供的微生物鉴定评价技术服务为客户开展“产品申报、质量控制、产品进出口、企业认证、污染菌溯源、发酵产品微生物解析和科研外协”等工作提供有效的技术保障。
形态学
普通细菌、酵母菌、霉菌、放线菌的菌落形态观察，菌体形态观察，菌体扫描电镜观察，透射电镜形态学观察。
分子生物学
特征序列分析
菌群分析
宏基因组分析
全基因组测序（二代）
全基因组完成图测序
微生物定量分析
菌株分型（RAPD、Riboprinter、SNP分析）
功能基因序列分析
数字DDH
化学分析
MALDI-TOF MS快速鉴定系统
MIDI sherlock脂肪酸分析鉴定系统
细胞壁组分分析（氨基酸、糖）
极性脂分析
呼吸醌分析
生理生化
VITEK全自动细菌鉴定系统
API鉴定试剂条
BIOLOG自动鉴定系统
耐药能力表型评价
动物致病性
活菌数
新种鉴定技术服务
微生物新种发表对全球系统微生物学研究影响深远。中国已成为全球系统微生物学研究最活跃的地区，《国际系统与进化微生物学杂志》（IJSEM）建议发表新种时，提供菌株全基因组测序（WGS）信息。CICC拥有丰富的新种鉴定及论文发表服务经验，提供包括模式菌株引进、菌种鉴定分析、公开保藏、技术咨询等在内的新种发表“一站式”技术解决方案，检测项目已通过ISO 17025实验室认可，检测结果获得国际互认，数据可靠性具有保障，为您提供专业化、规范化、国际化的技术服务。
生物资源引进
质控微生物是一类特征明确的标准培养物及其衍生菌株产品，广泛应用于食品、制药、化妆品和水行业以及检验检测机构的微生物学检验、质量控制和生产过程控制。根据实验用途不同，质控微生物产品可分为定量产品和定性产品。定量产品包含数量一定的微生物，可应用于对接种量有要求的质控实验；定性产品含有经准确分类鉴定的微生物，可作为阳性对照菌、标准验证菌使用。中国工业微生物菌种保藏管理中心与多家国际知名质控微生物产品生产商分别签订战略合作协议，包括法国生物梅里埃（bioMérieux）、美国赛默飞世尔科技（Thermo Fisher Scientific™）和美国Microbiologics®，成为其在中国授权的一级代理商，向国内相关行业和领域提供安全、精确和使用方便的质控微生物产品。
CICC是国际菌种保藏联合会（WFCC）成员之一，与国际知名微生物菌种保藏机构建立了长期交流与合作关系，与国际三大质控微生物生产商签署了中国区代理合作协议。CICC生物资源引进代理业务严格遵守国家相关政策法规，是我国率先开展微生物菌种引进服务的国家级菌种中心，已通过ISO 9001认证，致力于为我国工业企业、科研院所、高等院校等机构提供更安全、更专业、更便捷的菌种、细胞等生物资源引进服务。
生物制品菌种检定专题服务
2020版《中国药典》逐步与国际水平接轨，针对微生物菌种管理、菌种检定、菌株分型、菌株溯源、生产过程微生物监测、环境微生物监测等内容进行修订和补充，对我国制药企业在微生物监控管理方面提出了新的要求和挑战。CICC针对客户需求，对制药企业在新药申报生产菌种检测、生产过程中的微生物控制以及细胞库长期储存等方面开展服务。
生物制品通则
生物制品生产检定用菌毒种管理及质量控制：针对细菌性疫苗生产用菌种、重组工程菌生产用菌种的种、属、型分类鉴定、培养特性、菌落形态大小、革兰氏等染色方法镜检、抗生素抗性、生化反应、培养物纯度、全基因序列测定、目的产物表达量、透射电镜、目的基因序列、外源基因与宿主基因的鉴定、外源基因拷贝数、整合基因稳定性、目标产物的鉴别、质粒酶切图谱等项目进行检测。
人用疫苗
检测生产用菌种种子批的培养特性、纯度、外源因子污染、目的基因表达稳定性、生产稳定性等。
基因治疗制品
针对细菌种子批检测菌落形态、染色镜检、生化特性、抗生素抗性、电镜检查、质粒酶切图谱、噬菌体污染、基因型和表型的稳定、目的基因序列一致性、质粒测序、质粒拷贝数、有/无质粒细菌的比例、质粒产率等。
人用重组蛋白
应检测主细胞库的表型和基因型标记、目的基因拷贝数、基因插入或缺失、目的基因序列一致性、无外源因子污染、细胞基质的稳定性等。
微生态活菌制品
针对三级种子批检测培养特性及染色镜检、生化反应、毒性试验、细菌代谢产物——脂肪酸、遗传特性、抗生素敏感性、稳定性实验等。
细胞库长期储存
菌毒种经检定后，应根据其特性，选用冻干、液氮、≤-60℃冻存或其他适当方式及时保存。
不能冻干、液氮、≤-60℃冻存的菌毒种应根据其特性，置适宜环境至少保存2份或保存于2种培养基。
益生菌类产品检测专题
益生菌是一类当摄入一定数量水平时, 对宿主健康有益的活的微生物。近年来, 随着公众对健康营养需求的不断攀升，益生菌类产品也随之增多。菌株明确的分类学地位、安全性及产品的质量控制得到更多关注。
中国工业微生物菌种保藏管理中心专业从事微生物鉴定评价工作，通过CMA中国检验检测机构能力认定和ISO 17025检测实验室能力认可，满足企业对于益生菌计数、菌株精准鉴定及安全性评价的检测需求。
饲用微生物鉴定及安全性评价专题
为保障饲用微生物菌株的质量安全，加强菌株的管理，2019年11月农业农村部发布第226号公告，对新饲料添加剂申报中微生物鉴定和菌株安全性评价提出新要求。为进一步规范新饲料和新饲料添加剂安全性评价工作，2021年11月农业农村部发布了《直接饲喂微生物和发酵制品生产菌株鉴定及其安全性评价指南》农办牧[2021]43号文件，明确了饲料添加剂菌株的鉴定和安全性评价的技术要求。
CICC针对饲料企业客户产品申报需求，提供符合《直接饲喂微生物和发酵制品生产菌株鉴定及其安全性评价指南》要求的“一站式”微生物技术解决方案。